linuxだとTgifが定番。OpenOfficeのdrawが、漢字なepsも吐けて結構いいかも。
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Linux Japan 連載記事 「もう少しだけLinux」
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latex2html, tgif, gnuplot などなど。
GNUPLOT not so Frequently Asked Questions
PyChart Python スクリプトで高品質なグラフをお気楽に描くことができるライブラリ
琉球大学半場さんのページ tgif入門 & gnuplot入門
OmniGraffle NeXT, MacOS X用
のお絵かきツール。簡単かつきれいにブロック図などがかける
